統合ゲノム解析サーバ：GiGS

GeneBay integrated Genome Server

次世代シーケンサーの登場でゲノム配列決定はより身近になってきました。
しかし、ゲノム配列決定では膨大なデータを扱う必要があり、デーた解析や有用情報の発掘はより難しくなってきています。
増大するゲノム情報を有効に活用するためには、データを効率的に解析、保管し、必要な情報を高速に抽出できるコンピュータシステムが不可欠です。
ジーンベイは、この要求を満たすシステムとして、統合ゲノム解析サーバGiGSを提供いたします。
GiGSは、膨大なデータを効率よく格納し、高速に必要な情報を取り出し、解析結果をわかり易く表示します。また、お客様のご要望に応じて、画面レイアウトや表示項目をカスタマイズしたり、オプション機能を追加提供したりすることが可能です。

ゲノムビューワー

• 収録生物種とそれらのゲノム情報
  （染色体数、コンティグ数、遺伝子数などの統計情報表示）
• コンティグや染色体上に遺伝子地図を表示
• 翻訳領域・オペロン構造（原核生物ゲノムの場合）またはエキソン・イントロン構造（真核生物の場合）、tRNA、rRNAを表示

アノテーションビューワー

• Locus情報
• 翻訳領域情報、オペロン構造（またはエキソン・イントロン情報）
• DNA配列、アミノ酸配列
• 相同性解析結果（SwissProtなど）
• EC番号
• 蛋白質モチーフ（Pfam, PRINTS, prositeなど）
• シグナルペプチド、膜貫通部位

比較ゲノム解析機能

• オーソログ解析機能
• シンテニー解析機能
• ドットプロット解析機能
• 差分解析機能

変異解析システム（オプション）

• 変異箇所付近でのread配列のアライメント表示
• アノテーションによる変異の検索
  coding SNP, non-coding SNPなど
• 複数の変異株のリシーケンス解析結果をGiGS上に構築することよにり、さらに強力な解析が可能