メタショットガン解析

次世代シーケンサーの登場により、大量の塩基配列が加速度的に産出されるようになりました。そして、環境微生物群集を対象に、新たな大規模メタゲノム解析への次世代シーケンサーの利用が注目を集めています。
メタゲノム解析の目的としては、「環境中の微生物群集からの有用新機構その探索」や、「腸内・口腔環境や土壌・水質等の環境中に棲む微生物群集の調査」などが挙げられます。
ジーンベイでは、次世代シーケンシングサービスと組み合わせて、配列決定からデータ解析まで一連の解析を提供いたします。
メタショットガン解析では、細菌を解析するメタ16S解析と異なり、ウィルスや真菌（カビ）なども一網打尽にシーケンスすることが可能です。

メタショットガンシーケンシング

DNAサンプルを提供いただきます。DNA抽出から承ることも可能です。Illumina MiSeq/HiSeqシーケンサーが適しています。

メタショットガンデータ解析

解析の目的に応じて、様々な解析が可能です。
・アセンブリー解析
得られたリード配列をアセンブリーします。冗長なリード配列をまとめることで以降の膨大な計算負荷を軽減する効果が期待できます。また、質の良いコンティグ配列が得られれば、遺伝子配列や遺伝子クラスター配列の情報を知ることも可能です。
・アノテーション解析
メタゲノムアノテーションプログラムやBLASTXなどを用いて翻訳領域の予測とアノテーション解析を行います。この手法は特に有用酵素探索や環境中の微生物群集の機能予測などに有効です。