ランダムPCRによる、
ゲノムワイドなジェノタイピング技術
次世代シーケンサーを利用した新規マーカー技術 GRAS-Di®(Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct) は、ランダムプライマーを用いたPCR増幅により、ゲノムの複数箇所を配列決定し、ジェノタイピングを行う新規手法です。マーカー探索、マーカー選抜、QTL解析、連鎖地図等に利用できます。
詳細なGRAS-Di®技術内容に関しては、illumina社のウェビナーをご覧ください。
GRAS-Di®はトヨタ自動車株式会社の登録商標です。
GRAS-Di®によるジェノタイピング概念図

サービス内容
DNAサンプルをお送り頂くことでGRAS-Di用ライブラリ調製、シーケンス、データ解析を行います。
ライブラリ調製
ランダムプライマーによるPCR増幅、2nd PCRによるライブラリ調製を実施いたします。

シーケンス
対応可能機種

DNBSEQ

NovaSeq

MiSeq
データ解析
GRAS-Di®解析ソフトウェアによる解析【標準】
GRAS-Di® 解析ソフトウェアでの解析結果(アンプリコンごとのリード数、配列、増幅断片のサイズ、遺伝子型等)をExcelファイルとして納品いたします。

マッピング解析【オプション】
リファレンス配列が有る場合にはオプションでマッピング解析を承ります。
リファレンス配列へシーケンスデータをマッピングすることによりバリアントを検出いたします。

解析の流れ
STEP
サンプル送付(お客様)
gDNAまたはRNAサンプルをご送付いただきます。
STEP
クオリティチェック
ご送付いただいたサンプルのクオリティを確認いたします。
STEP
ライブラリー調製
各種アプリケーション用のライブラリーを調製いたします。
STEP
シーケンス
ご注文いただいた枚数のフローセルまたはデータ量指定でのシーケンスをいたします。
STEP
データ解析
オプションで各種データ解析を承ります。
豊富な解析プランを提供
- 相乗りプラン(お試しに最適):少数サンプルでの実施が可能
- 短納期で低価格のDNBSEQ に対応
- DNA抽出からデータ解析、カスタムプライマー設計までフレキシブルに対応