Rapid シーケンシングキットによる
バクテリアゲノム シーケンシング
数十kbp以上の長い配列断片を、一本のリードとして解読できるナノポアシーケンサーはゲノム構築の強力なソリューションとなるほか、メチル化解析、メタゲノム解析などにも活用可能です。
このたびは、バクテリア研究者様向けのキャンペーンを開始しました。
特長
- トランスポザーゼを挿入することでライブラリーを調製
- 納期とコストに優れる
解析事例（バクテリアゲノム構築）
Rapidシーケンシングキットによるデータの取得後、ナノポアリードによるde novoアセンブリー、ナノポアリードによるポリッシングを行いました。各コンティグ長ならびに、ショートリードによるエラー補正数を集計しました。
集計結果
※D株のエラー補正数が他の株に比べて多いのは、本株の塩基修飾が影響している可能性があります。
キャンペーン価格
有償オプション
- gDNA抽出
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ご提供いただいた菌体からのgDNA抽出も対応しております。菌種名を添えてご相談ください。
- アセンブリー解析、遺伝子アノテーション解析
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得られたデータを用いて、ゲノム構築ならびに遺伝子構造予測を行います。
オプションで、ショートリードデータによるポリッシングも承ります。 - Toxic遺伝子解析
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予測された遺伝子配列に対し、データベースに基づいた毒性遺伝子の探索を行います。
- メチル化解析、SNP/Indel 解析、構造変異解析
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マッピングベースの手法により、メチル化解析やSNP/Indel解析などを実施します。
（二倍体の生物については、フェージング解析も実施可能です）